计算化学公社

标题: tmp文件夹里的临时文件不自动青理了，占用很大内存，可以手动删除吗？ [打印本页]

作者
Author: wzm12天空 时间: 2023-6-12 20:20
标题: tmp文件夹里的临时文件不自动青理了，占用很大内存，可以手动删除吗？
如题

作者
Author: 乐平 时间: 2023-6-13 11:56
首先，纠正错别字。应该是“清理”，不是“青理”；
其次，概念错误。/tmp 目录下文件占用的是硬盘空间，不是占用内存；
最后，可以手动清理，而且你自己用户从权限角度来说，是无法删除掉 /tmp 目录下 root 权限的文件的，不会存在风险问题。

作者
Author: wzm12天空 时间: 2023-6-15 10:27

乐平发表于 2023-6-13 11:56
首先，纠正错别字。应该是“清理”，不是“青理”；
其次，概念错误。/tmp 目录下文件占用的是硬盘空间， ...

明白了，谢谢老师的解答

作者
Author: 过客 时间: 2024-12-4 01:47

乐平发表于 2023-6-13 11:56
首先，纠正错别字。应该是“清理”，不是“青理”；
其次，概念错误。/tmp 目录下文件占用的是硬盘空间， ...

您好！想请教一下，如果每算一个文件，临时文件都会出现一个几十G的文件是什么情况？怎么解决？我的分子只有不到20个原子。

作者
Author: 乐平 时间: 2024-12-6 16:09

过客发表于 2024-12-4 01:47
您好！想请教一下，如果每算一个文件，临时文件都会出现一个几十G的文件是什么情况？怎么解决？我的分子 ...

又是算命式的提问……

你用什么软件计算？得到什么临时文件？啥都没说……

另外，如果临时文件没有什么后续使用的场景，直接删掉就行了呀

作者
Author: 过客 时间: 2024-12-7 20:09

乐平发表于 2024-12-6 16:09
又是算命式的提问……

你用什么软件计算？得到什么临时文件？啥都没说……

感谢老师的回答！不好意思，自动代入高斯了，就是我在Linux上用高斯16算一个分子的时候，temp里面的临时文件，每算一个都会产生一个大小达到60G左右的临时文件，Gau开头，rwf为后缀。没有后续使用，但是过程中，临时文件太大了，导致系统报错，硬盘容量不足。这种是什么情况呢？

作者
Author: 乐平 时间: 2024-12-7 22:00

过客发表于 2024-12-7 20:09
感谢老师的回答！不好意思，自动代入高斯了，就是我在Linux上用高斯16算一个分子的时候，temp里面的临时 ...

.rwf 文件是 Gaussian 计算时候产生的临时读写文件（read write file），的确很大，且很关键（计算中途的电子积分等数据都保存在这个文件中）。正常结束的话，Gaussian 会自动删除 .rwf 文件；如果运行过程中报错，那么 .rwf 文件通常不会自动删除，你需要手动去删除它。

至于磁盘空间不足的情况，如果有其他磁盘，可以将 .rwf 文件拆分，分别放在不同的磁盘里。在你的输入文件里 % 开头的行里添加：

%rwf=/tmp/aaa.rwf, 40GB, /home/YOUR_DIR/2.rwf -1

复制代码

其中，/tmp 是临时文件目录，aaa.rwf 是差分后的 .rwf 文件，这里指定它为 40 GB。/home/YOUR_DIR 表示 /home/路径下你自己的目录名。通常集群里 /home 是最大的，是放置很多用户数据的公共磁盘区域，当然你自己的目录只能你自己有权限访问。-1 表示不指定大小，它最后有多大就是多大。

当然，计算结束后最好还是检查一下，是否有 .rwf 文件残留。如果有，就直接删除它。

作者
Author: 过客 时间: 2024-12-9 17:11

乐平发表于 2024-12-7 22:00
.rwf 文件是 Gaussian 计算时候产生的临时读写文件（read write file），的确很大，且很关键（计算中途的 ...

明白了，谢谢乐平老师!!

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