计算化学公社
标题:
ADT生成pdbqt文件,FE铁离子分配电荷为0
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作者Author:
liuyy1319
时间:
2023-6-13 21:30
标题:
ADT生成pdbqt文件,FE铁离子分配电荷为0
本帖最后由 liuyy1319 于 2023-6-13 21:33 编辑
ADT生成pdbqt文件,FE离子分配电荷为0。
一般有的金属离子参数文件没有,需要自己添加,再进行对接。
但是铁离子的参数文件,默认的参数文件中就包含(如下图),
试了多次不知道为何原因还是为0,不知道哪一步出错了,希望能解答下。
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作者Author:
sobereva
时间:
2023-6-14 10:11
参数信息和原子电荷是两码事,原子电荷得根据实际体系计算,诸如Gasteiger之类的计算原子电荷的方法都是对纯有机体系而言的
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