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标题: 基于受体的虚拟筛选求教 [打印本页]

作者
Author: xy12345 时间: 2023-6-15 15:19
标题: 基于受体的虚拟筛选求教
各位老师好，

刚刚进入CADD行业不久，有两个虚拟筛选的问题想请教。

1. 在基于受体的虚拟筛选时，假如没有晶体结构，但是有alphafold2预测的结构，预测结果口袋区域的准确度高，但是有些区域精确度低。假如只做对接，这样是否也可以接受
2. 假如口袋比较大，而且不确定真实作用的氨基酸残基是什么，那么对接很有可能在错误的位置，筛出来的化合物即使能结合在口袋中也不能发挥出正确的生物效应。一般如何克服这一问题。

谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-16 16:31
1 能保证对接的区域部分的结构足够可靠就可以
2 结合分子动力学模拟来验证。并且足够长的MD过程中可以令复合物结构在一定程度上往合理的方向去弛豫

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