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标题: 模型中水分子的运动受限的问题 [打印本页]

作者
Author: qmz301 时间: 2023-6-17 11:13
标题: 模型中水分子的运动受限的问题
请教大家：水分子运动受限制的模型中，为什么水分子会好像受到了某种限制而不能自由运动？如何将模型中的水分子改为可以自由运动的模型（如水分子不受限制的视频所示）？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-17 11:35
我不用M$，但看上去是初速度的产生或控温设置有问题。分子若有动能自然不可能几乎原地不动

作者
Author: qmz301 时间: 2023-6-17 11:50
感谢sobereva老师的回复。如视频“水分子运动受限制（298k）”所示，在将模型中的温度升高至298K后，水分子虽然会有剧烈运动，但仍然局限在固定区域内而不能像视频“水分子运动不受限制”中那样自由运动，请问sobereva老师这是什么原因？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-17 15:56

qmz301 发表于 2023-6-17 11:50
感谢sobereva老师的回复。如视频“水分子运动受限制（298k）”所示，在将模型中的温度升高至298K后，水分子 ...

M$的情况我不清楚，如果用gromacs模拟我能回答

作者
Author: qmz301 时间: 2023-6-18 15:12
感谢sobereva老师的回答，我将所有模块的属性更改为默认设置后问题解决了

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