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标题: gmx_MMPBSA_ana无法正常运行,无法对gmx_MMPBSA处理的结果作图 [打印本页]

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Jeffrey0521    时间: 2023-6-17 11:37
标题: gmx_MMPBSA_ana无法正常运行,无法对gmx_MMPBSA处理的结果作图
本帖最后由 Jeffrey0521 于 2023-6-17 11:38 编辑

我的操作系统是CentOS7,用的GROMACS版本是2019.6,分子动力学模拟及gmx_MMPBSA计算一切正常。但是可视化工具gmx_MMPBSA_ana完全无法打开,一直停留在reading files的窗口,且终端有如下报错
(, 下载次数 Times of downloads: 27) (, 下载次数 Times of downloads: 26)

qt.glx: qglx_findConfig: Failed to finding matching FBConfig for QSurfaceFormat(version 2.0, options QFlags<QSurfaceFormat::FormatOption>(), depthBufferSize -1, redBufferSize 1, greenBufferSize 1, blueBufferSize 1, alphaBufferSize -1, stencilBufferSize -1, samples -1, swapBehavior QSurfaceFormat::SingleBuffer, swapInterval 1, colorSpace QSurfaceFormat::DefaultColorSpace, profile  QSurfaceFormat::NoProfile)
No XVisualInfo for format QSurfaceFormat(version 2.0, options QFlags<QSurfaceFormat::FormatOption>(), depthBufferSize -1, redBufferSize 1, greenBufferSize 1, blueBufferSize 1, alphaBufferSize -1, stencilBufferSize -1, samples -1, swapBehavior QSurfaceFormat::SingleBuffer, swapInterval 1, colorSpace QSurfaceFormat::DefaultColorSpace, profile  QSurfaceFormat::NoProfile)
Falling back to using screens root_visual.
(, 下载次数 Times of downloads: 26)

网络上检索,类似都是QT3D出了问题,都是改代码。我检查了conda pip的确是安装了pyqt5的,有无遇到相同的情况,求解。


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Huschein    时间: 2023-6-17 12:55
知乎上有个gmx mmpbsa的安装帖子 它里面配的环境比较好,我之前参照官网的教程配环境都会出现报错,建议去看看知乎那篇
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Jeffrey0521    时间: 2023-6-17 14:17
Huschein 发表于 2023-6-17 12:55
知乎上有个gmx mmpbsa的安装帖子 它里面配的环境比较好,我之前参照官网的教程配环境都会出现报错,建议去 ...

你说的是https://zhuanlan.zhihu.com/p/528893992
我就是按照这个安装的,但是还是不行
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Huschein    时间: 2023-6-18 10:06
Jeffrey0521 发表于 2023-6-17 14:17
你说的是https://zhuanlan.zhihu.com/p/528893992吗
我就是按照这个安装的,但是还是不行

对的,你按照它的,然后再参考官网的环境配置,我记得我是两个混搭,因为报错原因是某个库版本的更新,这篇知乎也有一点年头了,具体的话你得看py报错在哪里了
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Jeffrey0521    时间: 2023-6-18 22:38
Huschein 发表于 2023-6-18 10:06
对的,你按照它的,然后再参考官网的环境配置,我记得我是两个混搭,因为报错原因是某个库版本的更新,这 ...

正常.py没问题,只是最后打开可视化界面打开才有问题,报错我都截图在上面了,就是因为不知道具体是哪个包出问题了才过来问的,这不能全部重新装一遍吧,毕竟结果的dat文件是出来了的。
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keplerze    时间: 2023-11-1 12:31
Unable to start gmx_MMPBSA_ana,大家有遇到这个报错么,怎么处理啊
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xsc6    时间: 2023-11-1 15:11
我也是遇到可视化有问题,但数据都是能够正常显示的,自己作图就好了
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hanlu    时间: 2024-3-24 16:36
keplerze 发表于 2023-11-1 12:31
Unable to start gmx_MMPBSA_ana,大家有遇到这个报错么,怎么处理啊

你好,麻烦问一下你这个问题处理好了么?




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