计算化学公社
标题:
化学信息学案例:分子对接、聚类分析、药效团识别等
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作者Author:
farfarcheng
时间:
2023-6-17 22:32
标题:
化学信息学案例:分子对接、聚类分析、药效团识别等
本帖最后由 farfarcheng 于 2023-6-17 22:35 编辑
【化学信息学】
化学信息学
是建立在多学科基础上的交叉学科,它运用计算机技术、统计学方法和化学知识,用以解决药物研发、材料设计、生物活性预测等方面的实际问题。我们熟悉的分子对接、QSAR、药效团识别等问题,都属于化学信息学的范畴。
在
AI for Science
时代,化学信息学软件通过结合深度学习、机器学习等技术,实现了许多前所未有的功能,提高了研究效率和成果质量。
【Notebook案例】
化学信息学的学习并非易事。
繁杂的教程资源四散各处,配置环境耗费大量时间,难以随着教程运行和修改代码,
学习过程充满挫折。
为了帮助大家学习和应用化学信息学,NBHub 为大家整理了一个丰富的
化学信息学 Notebook 系列
,
并将整个系列上传至了 Notebook 案例广场
https://nb.bohrium.dp.tech
!
通过案例的简单修改,就可以将化学信息学工具应用于自己的应用场景中,激发更多「化信」灵感。
你可以在案例广场通过搜索「
化学信息学
」来快速找到化学信息学系列 Notebooks。同时,我们已为你
预先配置好了所需的环境配置
,使用我们为你准备的在线 Notebook,你无需担心环境配置和依赖问题,仅需要专注于学习本身。依靠 Bohrium 平台
免费的 2 核 4G 计算资源
,你可以在平台上直接运行和修改代码。
在这里,我们为你带来了若干化学信息学案例,包括但不限于:
1.
TeachOpenCADD
软件系列案例:
https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1277
2.
RDkit
软件系列案例|以
「使用 Uni-Mol 构建 AI 模型的输入」
为例:
https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1063
3.
Psikit
软件系列案例|以「
二面角扫描
」为例:
https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1240
4.
Datamol
软件系列案例|以「
分子可视化
」为例:
https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1270
5.
Jupyter_Dock
软件系列案例|以「
分子对接
」为例:
https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1234
6.
ChemPy
软件系列案例|以「
氯化钠析出的多相化学平衡
」为例:
https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1269
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
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