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标题: 关于CP2K做meta-dynamic计算之前做预平衡的问题 [打印本页]

作者
Author: 秋心 时间: 2023-6-19 12:22
标题: 关于CP2K做meta-dynamic计算之前做预平衡的问题
各位老师好，最近在学习CP2K的meta-dynamic计算一个反应的势能面，遇到一个问题，一般做MD之前都需要做OPT，个人理解做OPT的过程类似于经典分子动力学模拟中的能量最小化，但是一般经典分子动力学模拟中在做成品模拟之前还需要做一步NPT或者NVT预平衡，那么做meta-dynamic计算之前需要做一个NPT或者NVT预平衡吗？做预平衡对于最后meta-dynamic的结果会有影响吗？我提出这个问题是因为最近看到了一篇文章（Heterogeneous Formation of HONO Catalyzed by CO2，Environ. Sci. Technol. 2021, 55, 12215−12222），该文在MATERIALS AND METHODS中提到了“采用30ps BOMD模拟的平衡结构作为元动力学模拟的输入结构”。

作者
Author: Weldingspock 时间: 2023-6-20 09:42
应该是需要的

作者
Author: 秋心 时间: 2023-6-20 13:18

Weldingspock 发表于 2023-6-20 09:42
应该是需要的

谢谢，苦于计算成本比较大，要不然可以做个对比看看结果。

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