计算化学公社

标题: 求助：MS软件怎么设置模拟时的初始速度？ [打印本页]

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作者
Author: 风起于夏    时间: 2023-6-19 15:24
标题: 求助：MS软件怎么设置模拟时的初始速度？
有没有老师知道怎么设置MS中模拟的初始速度，我看到只显示当前速度和随即速度，但是我想比较不同体系的扩散系数，想将它设置成一个值，想请教一下各位老师怎么操作？

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作者
Author: chenzhe    时间: 2023-6-19 16:58
用脚本处理。help里面有关于粒子初速度的设置。
比如下面这两行的意思就是将选定原子初速度设置为-10
foreach my $atom (@{$sorbant->Atoms}) {
                $atom->Velocity = Point ( X => -10, Y => 0, Z => 0 );}

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作者
Author: 风起于夏    时间: 2023-6-21 14:33

chenzhe 发表于 2023-6-19 16:58
用脚本处理。help里面有关于粒子初速度的设置。
比如下面这两行的意思就是将选定原子初速度设置为-10
fo ...

好的，谢谢您

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作者
Author: 风起于夏    时间: 2023-6-21 18:38

chenzhe 发表于 2023-6-19 16:58
用脚本处理。help里面有关于粒子初速度的设置。
比如下面这两行的意思就是将选定原子初速度设置为-10
fo ...您好，我刚接触到perl,看了一下HELP，改了之后发现不太对
my $doc = $Documents{"daosan.xsd"};

my $H2 = $doc-> Unitcell-> Sets("H2")->Atoms;

foreach my $atom (@$H2){$atom->Velocity = Point ( X => -10, Y => 0, Z => 0 );}
my $results = Modules->Forcite->Dynamics->Run($doc, Settings(
        "3DPeriodicvdWAtomCubicSplineWidth" => 3,
        "3DPeriodicNonBond2BodyListBufferWidth" => 1,
        CurrentForcefield => "pcff",
        Ensemble3D => "NVT",
        Pressure => 0.0001,
        NumberOfSteps => 1000000,
        TrajectoryFrequency => 1000,
        InitialVelocities => "Random",
        StressXX => -0.0001,
        StressYY => -0.0001,
        StressZZ => -0.0001));
my $outTrajectory = $results->Trajectory;
我的晶胞是无定形晶胞，不能使用Unitcell,应该怎么改呢，而且这样设置速度的话，是初始速度还是整个过程的速度，谢谢。

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