计算化学公社

标题: 高斯结构优化后计算频率时出现问题 [打印本页]

作者
Author: Conan 时间: 2023-6-20 09:39
标题: 高斯结构优化后计算频率时出现问题
服务器新安装了高斯后使用opt freq关键词进行结构优化和频率计算发现第一步结构优化结束后，频率计算出现以下问题，想问一下是什么原因，还请各位老师帮忙解决，服务器里的任务已经结束了。（log文件太大了）

Job cpu time:    4 days 15 hours 13 minutes 37.6 seconds.
Elapsed time:    0 days  5 hours  8 minutes 22.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 350 Int=    0 D2E=    0 Chk=    45 Scr=    2
Normal termination of Gaussian 16 at Tue Jun 20 05:18:21 2023.
Link1:  Proceeding to internal job step number  2.
-----------------------------------------------------------------
#N Geom=AllCheck Guess=TCheck SCRF=Check GenChk RM06/def2SVP Freq
-----------------------------------------------------------------
1/10=4,29=7,30=1,38=1,40=1/1,3;
2/12=2,40=1/2;
3/5=43,7=101,11=2,14=-4,25=1,30=1,70=2,71=2,74=-54,116=1,124=31,140=1/1,2,3;
4/5=101/1;
5/5=2,38=6,98=1/2;
8/6=4,10=90,11=11/1;
11/6=1,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10;
10/6=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7/8=1,10=1,25=1/1,2,3,16;
1/10=4,30=1/3;
99//99;
Structure from the checkpoint file:  "V4C17lizia-1.chk"
（这是前面结构优化后的部分）

CoulSu:  requested number of processors reduced to:  16 ShMem 1 Linda.
Calling FoFCou, ICntrl=  3107 FMM=T I1Cent= 0 AccDes= 0.00D+00.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:  16 ShMem 1 Linda.
Calling FoFCou, ICntrl=  3107 FMM=T I1Cent= 0 AccDes= 0.00D+00.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:  16 ShMem 1 Linda.
End of G2Drv F.D. properties file 721 does not exist.
End of G2Drv F.D. properties file 722 does not exist.
End of G2Drv F.D. properties file 788 does not exist.
      IDoAtm=11111111111111111111111111111111111111111111111111
      IDoAtm=1111111111111111111111111
      Differentiating once with respect to electric field.
            with respect to dipole field.
      Differentiating once with respect to nuclear coordinates.
Estimated number of processors is: 21
CalDSu exits because no D1Ps are significant.
      There are 228 degrees of freedom in the 1st order CPHF.  IDoFFX=6 NUNeed=    3.
228 vectors produced by pass  0 Test12= 9.80D-14 1.00D-09 XBig12= 3.19D+02 2.82D+00.
Estimated number of processors is: 21
AX will form    3 AO Fock derivatives at one time.
228 vectors produced by pass  1 Test12= 9.80D-14 1.00D-09 XBig12= 2.42D+02 1.79D+00.
Estimated number of processors is: 21
227 vectors produced by pass  2 Test12= 9.80D-14 1.00D-09 XBig12= 9.62D+00 3.18D-01.
Estimated number of processors is: 21
（这是log文件最后）

作者
Author: fatpig 时间: 2023-6-20 09:57
盲猜用的core数过多，可以调小后重算freq部分...

作者
Author: 钠离子电池 时间: 2023-6-20 11:00
你确定算完了吗？根据这个帖子http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html
End of G2Drv F.D. properties file 721 does not exist.
End of G2Drv F.D. properties file 722 does not exist.
End of G2Drv F.D. properties file 788 does not exist.
这几个语句的含义不明，但不是报错。其常被用户误以为是报错的原因是其出现在计算频率时较为耗时的进程前面，对较耗时的体系没有新的输出，故而使用户误以为“跑到这里就卡死了”，但其实经常是高斯正在进行计算，确认高斯还在运行中之后等待算完即可。

作者
Author: Conan 时间: 2023-6-20 14:19

fatpig 发表于 2023-6-20 09:57
盲猜用的core数过多，可以调小后重算freq部分...

感谢回答，我去试一下

作者
Author: Conan 时间: 2023-6-20 14:23

钠离子电池发表于 2023-6-20 11:00
你确定算完了吗？根据这个帖子http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html
End of G2Drv F.D. propertie ...

感谢回答，任务肯定是跑完了（或者可能根本没跑起来），所以想询问一下出现这个问题的原因，之前的服务器里面也有高斯，跑相同的任务时即使是报错也不是出现这样的信息

作者
Author: 钠离子电池 时间: 2023-6-20 15:16
不过你说了log文件太大了，很难是没跑起来，毕竟没跑起来的log应该很小的。
你可以再去log文件里找找具体的报错信息了，如果真的是报错停止的话。然后结合我在3l贴的帖子解决一下。

作者
Author: Conan 时间: 2023-6-20 15:34

钠离子电池发表于 2023-6-20 15:16
不过你说了log文件太大了，很难是没跑起来，毕竟没跑起来的log应该很小的。
你可以再去log文件里找找具体 ...

好的感谢，已经在试了，我觉得更像是先进行了结构优化，结构优化收敛了之后再进行频率计算，但是频率计算没跑起来或者哪里出错了

作者
Author: 钠离子电池 时间: 2023-6-20 17:58
我刚刚跑了一下输入文件，我这边显示的问题是l103.感觉我这边甚至几何优化都没跑完。

作者
Author: Conan 时间: 2023-6-20 20:03

钠离子电池发表于 2023-6-20 17:58
我刚刚跑了一下输入文件，我这边显示的问题是l103.感觉我这边甚至几何优化都没跑完。

主要是我这边报错信息都没有，很奇怪，所以在想会不会是高斯出现bug了

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-20 20:17

Conan 发表于 2023-6-20 20:03
主要是我这边报错信息都没有，很奇怪，所以在想会不会是高斯出现bug了

周经问题

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作者
Author: Conan 时间: 2023-6-20 20:48

sobereva 发表于 2023-6-20 20:17
周经问题

感谢老师，我试一下

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