计算化学公社

标题: 求助：请问gromacs怎么统计自扩散系数沿着z轴方向的变化？ [打印本页]

作者
Author: Lisy 时间: 2023-6-20 14:57
标题: 求助：请问gromacs怎么统计自扩散系数沿着z轴方向的变化？
请问gromacs怎么统计自扩散系数沿着z轴方向的变化？平时统计的都是整个体系平均的扩散系数~

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-20 20:28
之前论坛里有很多类似的讨论，分析局部区域的扩散系数的
简单来说，光靠GROMACS自带的工具没法实现。需要自己写脚本/程序，动态判断处在不同Z范围内的分子来计算扩散系数

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