计算化学公社

标题: 请教packmol填充DMSO的问题 [打印本页]

作者
Author: jia1012428 时间: 2023-6-20 17:12
标题: 请教packmol填充DMSO的问题
老师，我packmol操作没有问题了，我按您说的，把水的pdb里的残基名改成h2o，运行packmol结果正常，水可以被填充。但是我把dmso的pdb文件中的UNK改成dmso，运行packmol只填充dmso，结果总是报错，请问这是为什么，我哪里没有注意到。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-20 20:12
弄清楚pdb格式的定义，google搜pdb format，搞清楚哪几列用于记录残基名，别随意改

作者
Author: jia1012428 时间: 2023-7-16 23:12
谢谢，已学习！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)