计算化学公社

标题: 求助：怎么输出电场强度 [打印本页]

作者
Author: wuxiaofei 时间: 2023-6-20 22:20
标题: 求助：怎么输出电场强度
我在mdp文件中施加了电场，想看一下是否正确，怎么输出如下图形

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-20 23:25
mdrun加上-field指定输出的记录电场信息的xvg文件名，之后对xvg作图

作者
Author: wuxiaofei 时间: 2023-6-21 08:48

sobereva 发表于 2023-6-20 23:25
mdrun加上-field指定输出的记录电场信息的xvg文件名，之后对xvg作图

好的，谢谢老师

作者
Author: wuxiaofei 时间: 2023-6-21 10:33

sobereva 发表于 2023-6-20 23:25
mdrun加上-field指定输出的记录电场信息的xvg文件名，之后对xvg作图

老师，我施加频率为1000HZ 电压为1V，模拟步长300ns是不在gromacs里边不现实，electric-field-y = 0.28 0.000001 0 0；我看到输出的电场强度数据都是0.28，是不因为频率太小只会走一个周期的一点点，导致像是施加了恒定电场

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-21 14:02

wuxiaofei 发表于 2023-6-21 10:33
老师，我施加频率为1000HZ 电压为1V，模拟步长300ns是不在gromacs里边不现实，electric-field-y = 0.28 0 ...

是

作者
Author: lees 时间: 2023-7-11 10:41

sobereva 发表于 2023-6-21 14:02
是

请问老师，gromacs如何修改mdp来施加非对称的余弦的电场

作者
Author: lees 时间: 2023-7-11 10:43
请教楼主是否知道如何施加非对称性余弦电场

作者
Author: wuxiaofei 时间: 2023-7-12 15:46

lees 发表于 2023-7-11 10:43
请教楼主是否知道如何施加非对称性余弦电场

我理解的是在三个方向设置不同的参数，我上边是给y轴设置了。

作者
Author: wuxiaofei 时间: 2023-7-12 15:47

lees 发表于 2023-7-11 10:43
请教楼主是否知道如何施加非对称性余弦电场

作者
Author: lees 时间: 2023-7-12 16:04

wuxiaofei 发表于 2023-7-12 15:46
我理解的是在三个方向设置不同的参数，我上边是给y轴设置了。

谢谢楼主的回答，经sob老师回答说只能通过改源程序达到目的，mdp修改没法设，现在正在研究源程序部分

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