计算化学公社

标题: 有关LBO和Mayer分析的问题 [打印本页]

作者
Author:
dzdhp    时间: 2023-6-21 10:24
标题: 有关LBO和Mayer分析的问题
用ORCA跑了一个有机弱酸和碱之间的质子转移,方法用的是B973C,此过程氢从氧转移到氮上,我保留了每帧的波函数文件,按照sob老师教的脚本用Multiwfn计算了每帧的mayer键级和LBO,然后绘成图(图中红线为O-H,黑线为N-H),从图上看mayer键级还算比较合理,在200ps左右O-H断裂形成N-H,并且之后比较稳定。但是LBO就有点奇怪了,N-H持续波动且范围较大,sob老师原文里N-H的LBO值在0.86左右。请教一下各位老师导致LBO波动的可能原因是啥,是因为转移过去后共用电子都是N提供的吗,我该如何解释此波动,还是说这本来就是正常的。

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-6-21 14:11
可能是默认的积分格点不够多,导致结构变动时数值误差波动大所致。把Multiwfn的settings.ini里的iautointgrid设为0,然后尝试,如果波动还大,把radpot和sphpot都适当改大再试。如果改大后还是波动大,可能是LBO计算涉及的原子间重叠空间区域随结构变化变动得比较厉害,这时候可以在比如origin里对数据做个smoothing对相邻帧几帧数据取平均来得到平滑化的曲线。
作者
Author:
dzdhp    时间: 2023-6-21 15:02
sobereva 发表于 2023-6-21 14:11
可能是默认的积分格点不够多,导致结构变动时数值误差波动大所致。把Multiwfn的settings.ini里的iautointgr ...

感谢sob老师百忙中抽空回复,我这就去试试




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3