计算化学公社

标题: forcite 模块分子动力学模拟出现变形问题 [打印本页]

作者
Author: goodboy 时间: 2023-6-21 20:14
标题: forcite 模块分子动力学模拟出现变形问题
利用packmol模块进行建模后，为什么建模的分子会发生变形，进行分子模拟后，他吸附的分子会四处乱跑，求各位老师帮忙解答一下到底是什么原因，该采取什么措施？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-21 21:39
我不用forcite，注意搞清楚是否只是记录轨迹时没有考虑PBC而已

作者
Author: goodboy 时间: 2023-6-22 14:58

sobereva 发表于 2023-6-21 21:39
我不用forcite，注意搞清楚是否只是记录轨迹时没有考虑PBC而已

老师，我没有明白您说的具体是什么意思，这个PBC是什么意思

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-23 01:13

goodboy 发表于 2023-6-22 14:58
老师，我没有明白您说的具体是什么意思，这个PBC是什么意思

periodic boundary condition

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)