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标题: VASP优化布洛芬分子一直跑散架，有没有老师帮忙看看，感谢 [打印本页]

作者
Author: jxywanone77 时间: 2023-6-25 17:26
标题: VASP优化布洛芬分子一直跑散架，有没有老师帮忙看看，感谢
vasp优化布洛芬分子一直跑散架，有没有老师能帮忙看看是哪里出问题

作者
Author: 乐平 时间: 2023-6-25 22:38
如果虚线框是“晶胞”（模拟盒子）的话，你的“晶胞”（模拟盒子）小了，具体而言是左右“窄了”。

在使用 VASP, Quantum Espresso, CP2K 等等这类基于周期性边界条件的计算软件的时候，要始终牢记模拟的体系是在空间中无限延伸的。也就是说，不要仅仅只看到你眼前显示的分子，而要把它相邻的（左右，前后，上下）分子都考虑进来。

你可以用可视化软件“扩胞”看看，测量一下左右两边最近的两个原子间的距离。你目前的模型一定是小于2 A 的，也就意味着相邻两个“晶胞”或者叫“盒子”里的分子是有较强的相互作用的。于是，它们之间在计算过程中就有可能“发生反应”，导致结构分解。

所以，你需要将你的模拟盒子（“晶胞”）增大，尤其是目前截图里的左右两边增大。

作者
Author: jxywanone77 时间: 2023-6-26 08:39

乐平发表于 2023-6-25 22:38
如果虚线框是“晶胞”（模拟盒子）的话，你的“晶胞”（模拟盒子）小了，具体而言是左右“窄了”。

在使 ...

明白了，谢谢老师~

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