计算化学公社

标题: 【已解决】：给结构添加周期性边界条件 [打印本页]

---

作者
Author: luogaoyang123    时间: 2023-6-26 16:03
标题: 【已解决】：给结构添加周期性边界条件


各位老师好，我在lammps跑的xyz结构，导入MS中没有周期性，请问能否添加一个周期性盒子将结构括住？

---

作者
Author: 乐平    时间: 2023-6-26 16:34
在 LAMMPS 里得到了结果，为什么导入到 M$ 里呢……

---

作者
Author: luogaoyang123    时间: 2023-6-26 16:40

乐平 发表于 2023-6-26 16:34
在 LAMMPS 里得到了结果，为什么导入到 M$ 里呢……

不会用lammps做吸附，用MS试一下

---

作者
Author: sobereva    时间: 2023-6-26 23:44
在lammps框架内解决就完了，别弃明投暗

---

作者
Author: luogaoyang123    时间: 2023-6-27 09:12

sobereva 发表于 2023-6-26 23:44
在lammps框架内解决就完了，别弃明投暗

sob老师，是导文件的格式需要调整吗？

---

作者
Author: 乐平    时间: 2023-6-27 10:45

luogaoyang123 发表于 2023-6-27 09:12
sob老师，是导文件的格式需要调整吗？

Sob 老师的意思是，直接在 LAMMPS 里做吸附，别用 M$

当然，如果你的后续计算是吸附的分子发生化学反应，那么 LAMMPS 显然不太合适…… 除非能找到合适的反应性势场。

---

作者
Author: luogaoyang123    时间: 2023-6-27 13:58

乐平 发表于 2023-6-27 10:45
Sob 老师的意思是，直接在 LAMMPS 里做吸附，别用 M$

当然，如果你的后续计算是吸附的分子发生化学反 ...

我想做的是吸附等温线 不涉及反应 感觉lammps单核效率很低 用GCMC算有些参数设置也不太懂

---

作者
Author: luogaoyang123    时间: 2023-6-27 13:58

乐平 发表于 2023-6-27 10:45
Sob 老师的意思是，直接在 LAMMPS 里做吸附，别用 M$

当然，如果你的后续计算是吸附的分子发生化学反 ...

乐平老师有做吸附等温线的例子吗

---

作者
Author: sobereva    时间: 2023-6-27 23:16

luogaoyang123 发表于 2023-6-27 13:58
我想做的是吸附等温线 不涉及反应 感觉lammps单核效率很低 用GCMC算有些参数设置也不太懂

M$效率更低，而且更弱
设置看不懂就多读书和文献

---

作者
Author: luogaoyang123    时间: 2023-6-28 08:47

sobereva 发表于 2023-6-27 23:16
M$效率更低，而且更弱
设置看不懂就多读书和文献

好的 谢谢sob老师

---

欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)

Powered by Discuz! X3.3