计算化学公社

标题: 求助gromacs如何获得热容-温度曲线 [打印本页]

作者
Author: 古德猫宁341 时间: 2023-6-26 22:01
标题: 求助gromacs如何获得热容-温度曲线
各位老师好，我看了一篇使用TraPPe-UA力场模拟聚乙烯结晶过程的文献。文献中有一张比容和热容对温度进行作图的图像，如图。
请问在gromacs中要如何得到这种连续的热容-温度的曲线？gmx energy -fluct_props命令得到的好像是整个过程中热容的平均值？

如果需要在不同的温度下跑NPT然后用这个命令求比热，由于控温过程中温度会有上下几K的波动，我该如何获得对应温度下的热容呢？请各位老师指教，谢谢
(, 下载次数 Times of downloads: 7)

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-26 23:10
写个shell脚本，热浴的参考温度每提升一点就跑一次模拟
图上的温度坐标取MD过程的平均温度

作者
Author: 古德猫宁341 时间: 2023-6-27 15:03

sobereva 发表于 2023-6-26 23:10
写个shell脚本，热浴的参考温度每提升一点就跑一次模拟
图上的温度坐标取MD过程的平均温度

谢谢sob老师

作者
Author: zhaoxy008 时间: 2025-1-22 22:44
请问楼主看的时那篇文献？

作者
Author: 古德猫宁341 时间: 2025-2-4 15:10

zhaoxy008 发表于 2025-1-22 22:44
请问楼主看的时那篇文献？

https://doi.org/10.1021/acs.macromol.5b00823

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)