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标题: 我需要把BGLC残基的定义添加到oplaa力场的rtp文件中，请问我该如何获得BGLC残基的信息 [打印本页]

作者
Author: zzzzzhou 时间: 2023-6-28 11:13
标题: 我需要把BGLC残基的定义添加到oplaa力场的rtp文件中，请问我该如何获得BGLC残基的信息
我需要把BGLC残基的定义添加到oplaa力场的rtp文件中，请问我该如何获得BGLC残基的信息

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-29 07:37
提问时把问题描述清楚，BGLC是论坛里绝大多数人都不认识的缩写
“残基的信息”指代不明

仔细看下文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

作者
Author: zzzzzhou 时间: 2023-6-29 09:40

sobereva 发表于 2023-6-29 07:37
提问时把问题描述清楚，BGLC是论坛里绝大多数人都不认识的缩写
“残基的信息”指代不明

好的老师，我用cellulose-builder构建的纤维素用gromacs的pdb2gmx添加opls力场时出现以下报错[attach]70702[/attach]
但是我不知道在哪里可以获取这个BGLC残基的定义

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-29 23:43

zzzzzhou 发表于 2023-6-29 09:40
好的老师，我用cellulose-builder构建的纤维素用gromacs的pdb2gmx添加opls力场时出现以下报错
但是我不 ...

GROMACS里自带的OPLS-AA本来就不适用于糖
用支持糖的力场

作者
Author: zzzzzhou 时间: 2023-6-30 09:16
好的谢谢老师，我在文献里还看到纤维素用clycam06力场，请问可以用sobtop来生成这个力场下的拓扑文件吗

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