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标题: 分子结构优化后生成不了prm文件该怎么解决? [打印本页]

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xuyangyang    时间: 2023-6-30 08:07
标题: 分子结构优化后生成不了prm文件该怎么解决?
本人进行分子结构优化,这个分子结构优化成功了却生成不了prm文件,有没有人能帮我一下啊 呜呜,
优化后的结果以放入附件中,我是CHARMM 36 力场的

麻烦大家教我一下怎么解决这个问题

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wzkchem5    时间: 2023-6-30 18:07
生成prm文件的方法不是唯一的,必须详细列出你是怎么生成的prm文件,并且给出完整的报错信息,我们才能回答
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xuyangyang    时间: 2023-6-30 18:37
wzkchem5 发表于 2023-6-30 18:07
生成prm文件的方法不是唯一的,必须详细列出你是怎么生成的prm文件,并且给出完整的报错信息,我们才能回答

啊,我们现在就是不会生成prm文件,不会方法,所以才来咨询一个方法,我们用过CGENFF 网站,生成不了 ,想问问还有其他方法吗,感谢感谢
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wzkchem5    时间: 2023-7-1 02:27
xuyangyang 发表于 2023-6-30 11:37
啊,我们现在就是不会生成prm文件,不会方法,所以才来咨询一个方法,我们用过CGENFF 网站,生成不了 , ...

你还是没有回答我的问题。用CGENFF网站生成的时候,CGENFF网站具体报错的信息是什么?搞不好改一个什么设置就可以让CGENFF网站成功生成prm文件,但是你必须给CGENFF网站的报错信息,我们才能知道需要改什么。如果碰了壁不问原因就换路线,那科研永远也做不出来,因为再顺的研究路线也会有碰壁的时候。
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sobereva    时间: 2023-7-1 07:04
看清楚板块再发贴,分子模拟问题别发到量子化学版块
这次给你移动了,以后注意!

认真把此文看了,把关键性信息补充,否则等于完全无效的提问,提问时要有点最基本的逻辑
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html


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Winnky    时间: 2023-10-31 00:13
使用cgenff_charmm2gmx_py3_nx2.py这个脚本就可以对CGenFF产出的.str文件做出.prm文件了




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