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标题: gmx hbond氢键分析报错 [打印本页]

作者
Author: Wxy1998 时间: 2023-6-30 10:01
标题: gmx hbond氢键分析报错
在做请见分析时用到如下命令gmx hbond -f NPT.xtc -s NPT.tpr -dist -ang -life -nhbdist
出现如图报错，请问这是没有氢键的意思吗，该如何解决

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-1 07:09
没找到氢键受体
你不说体系特征、选了什么组，没法回答
记得gmx hbond是把N-H、O-H视为氢键给体，选的组里必须包含这样的原子对才行

作者
Author: Wxy1998 时间: 2023-7-4 11:14

sobereva 发表于 2023-7-1 07:09
没找到氢键受体
你不说体系特征、选了什么组，没法回答
记得gmx hbond是把N-H、O-H视为氢键给体，选的组 ...

谢谢sob老师我下去看下

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