计算化学公社

标题: IRC曲线中间平不光滑,另一个IRC分析延长步数结果不对 [打印本页]

作者
Author:
qjy111    时间: 2023-7-4 09:56
标题: IRC曲线中间平不光滑,另一个IRC分析延长步数结果不对
本帖最后由 qjy111 于 2023-7-4 14:49 编辑

请问一下,一个氨基与CO2的反应,离子液体,
对第一步反应进行过渡态搜索,验证只有一个虚频,进行IRC分析,反应物和生成物对对应上了,但是这个IRC有点怪,中间是平的,第一步反应主要是角度,键长之类的改变 (, 下载次数 Times of downloads: 4)
第二步反应进行过渡态搜索,验证只有一个虚频,进行IRC分析,反应物和生成物对对应上了,过渡态对,但是由于没平,故延长maxpoint=30,
(, 下载次数 Times of downloads: 3)
但是由于开头与结尾没平,不是最终反应物与生成物,故延长maxpoint=30,但是结果出于了我的预期,反应物和生成物对对应不上,反应物和生成物不参与反应的部分coo-出现断键,形成CO2,想请问一下是不是说明上面两个过渡态都没搜索对,可以怎么解决

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-7-5 04:41
1 IRC计算存在硬伤,看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.keinsci.com/thread-7736-1-1.html

2 过渡态不是你期望的那个。结合当前对IRC两端优化得到的结构,以及其它结构,尝试摆合适的初猜寻找自己想找的,以及考虑自己对机理的预期是否正确
作者
Author:
qjy111    时间: 2023-7-5 16:41
本帖最后由 qjy111 于 2023-7-5 16:43 编辑
sobereva 发表于 2023-7-5 04:41
1 IRC计算存在硬伤,看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400http://bbs.kein ...

好滴,谢谢sob老师。老师,还想请问一下,有两步反应的情况下,计算反应势垒时的第一步生成物也就是第二步的反应物,是以第一步IRC中的生成物进行优化,以此作为基准,还是以第二步IRC中的反应物进行优化后的反应物作为基准,如图上的IM
(, 下载次数 Times of downloads: 3)

F:\浏览器下载\t1sd1q9d.png






欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3