计算化学公社

标题: 求助晶体和溶液的uv-vis光谱与文献呈现的规律相反 [打印本页]

作者
Author: Iris_1 时间: 2023-7-4 23:10
标题: 求助晶体和溶液的uv-vis光谱与文献呈现的规律相反
复现一个材料的solid state uv-vis光谱，激发态计算方法为pbe1pbe/def2tzvp，激发态为50个。文献中晶体光谱相对于溶液是红移的，文献中其他7种材料也都是【晶体光谱相对于溶液光谱是红移的】，（因为某些原因不方便贴上来），而个人计算的晶体光谱相对于溶液是蓝移的，不知道问题出在哪里。晶体uv-vis完全按照sob老师的【基于背景电荷计算分子在晶体环境中的吸收光谱】做的。计算的所有文件添加在了附件中，恳求指导，感谢！

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-7-4 23:17
会不会是因为有一个氨基氢其实不在氨基上，而在杂环上？毕竟一般XRD解不出氢原子

作者
Author: Iris_1 时间: 2023-7-5 00:04

wzkchem5 发表于 2023-7-4 23:17
会不会是因为有一个氨基氢其实不在氨基上，而在杂环上？毕竟一般XRD解不出氢原子

感谢老师的解答，这个文献里测了8种材料，其他7种材料也都是【晶体光谱相对于溶液光谱是红移的】，（因为某些原因不方便贴上去），所以或许不是氨基氢的原因。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-5 02:54
不要自己在标题里手写[新手求助]这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了，以后注意

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-5 03:29
可以尝试用CP2K直接对晶体算光谱
使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态
http://sobereva.com/634（http://bbs.keinsci.com/thread-28006-1-1.html）
光拿单个分子结合背景电荷，没法比如展现分子间电荷转移激发等效应。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-7-5 05:22

Iris_1 发表于 2023-7-4 17:04
感谢老师的解答，这个文献里测了8种材料，其他7种材料也都是【晶体光谱相对于溶液光谱是红移的】，（因为 ...

另外即使不用CP2K，也可以计算若干个分子组成的团簇，团簇外面的分子用背景电荷描述

作者
Author: Iris_1 时间: 2023-7-5 07:21

sobereva 发表于 2023-7-5 02:54
不要自己在标题里手写[新手求助]这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次 ...

谢谢sob老师，以后一定注意

作者
Author: Iris_1 时间: 2023-7-5 07:22

sobereva 发表于 2023-7-5 03:29
可以尝试用CP2K直接对晶体算光谱
使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态
http ...

好的老师，我用cp2k做一下

作者
Author: Iris_1 时间: 2023-7-5 07:23

wzkchem5 发表于 2023-7-5 05:22
另外即使不用CP2K，也可以计算若干个分子组成的团簇，团簇外面的分子用背景电荷描述

明白了老师，感谢您的解答！

作者
Author: tiandikuoyuan 时间: 2023-7-5 14:54
文献上这个晶体可见光区的吸收峰不是相对于溶液吸收峰发生蓝移吗？你首先应该把计算的溶液吸收光谱和文献实验测得的光谱对上，目前看峰值差的有点多，看下文献是在什么溶剂中测的，有没有加酸碱。

作者
Author: Iris_1 时间: 2023-7-5 23:43

sobereva 发表于 2023-7-5 03:29
可以尝试用CP2K直接对晶体算光谱
使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态
http ...

老师您好，按照您的【使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和分析电子激发态】对晶体激发态进行了cp2k计算，超晶胞共1075原子，晶胞尺寸16.41,17.50,20.65，使用64核进行计算，13小时后报错：Primary job terminated normally, but 1 process returned a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.请问老师这个报错的问题出在哪，该如何解决呢。感谢老师指导！

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-6 09:37

Iris_1 发表于 2023-7-5 23:43
老师您好，按照您的【使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和分析电子激发态】对晶体激发态进 ...

没输入输出文件没法判断
大概率是内存不够崩了
一般计算条件算1000原子TDDFT太费劲。尝试用CP2K的sTDA代替TDA-DFT（但此时溶液下也得用sTDA才能对比）

按前面别人说的，仍然用背景电荷，考虑更多中心分子也可以试试

作者
Author: Iris_1 时间: 2023-7-6 09:47

sobereva 发表于 2023-7-6 09:37
没输入输出文件没法判断
大概率是内存不够崩了
一般计算条件算1000原子TDDFT太费劲。尝试用CP2K的sTDA ...

感谢sob老师的指导，我用更多中心分子试试

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