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标题: LDH+水的盒子加完离子之后模型变形 [打印本页]

作者
Author: 蒋杭廷 时间: 2023-7-5 10:42
标题: LDH+水的盒子加完离子之后模型变形
做了一个LDH+水的盒子，如图1。然后往里加了1M的KCl溶液之后，模型就变成了如图2，OH键全部集中在LDH位置的上侧，Al集中在下侧，Co无法识别，然后K离子和Cl离子显示成了一样的颜色绿色。而且为啥MS做完的模型，在vmd没办法显示残基名呢，就是vmd中那个resname，只显示了LDH的一个整体，没有区别出来离子。请问这两个问题该怎么解决呢。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-6 10:16
载入VMD的pdb文件里必须有残基名才行，自行检查便知，M$没产生就自己想办法补上
并且确保pdb文件里记录了元素信息，免得VMD根据原子名猜不对元素
在VMD程序里对不同元素的原子用不同颜色显示的方法
http://sobereva.com/624（http://bbs.keinsci.com/thread-26306-1-1.html）

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