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标题: xtc轨迹去除水分子后，原本的gro和新的xtc中的原子数目对不上了 [打印本页]

作者
Author: 蒋杭廷 时间: 2023-7-5 15:30
标题: xtc轨迹去除水分子后，原本的gro和新的xtc中的原子数目对不上了
xtc轨迹去除水分子后，原本的gro和新的xtc中的原子数目对不上了，报错如图。

作者
Author: 对抗路达摩 时间: 2023-7-5 17:51
用make_ndx做出来non-water的index，之后对gro用editconf -n index.ndx输出non-water的gro。

作者
Author: 蒋杭廷 时间: 2023-7-6 10:10

对抗路达摩发表于 2023-7-5 17:51
用make_ndx做出来non-water的index，之后对gro用editconf -n index.ndx输出non-water的gro。

用您的方法解决了，谢谢您。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-6 10:18
用trjconv对gro文件也做同样的处理

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