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标题: Gaussian中,取柔性扫描后的每个点进行TDDFT激发态和单点能计算是否合理? [打印本页]

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chenshi    时间: 2023-7-6 10:29
标题: Gaussian中,取柔性扫描后的每个点进行TDDFT激发态和单点能计算是否合理?
各位老师好,目前我在尝试用Gaussian模拟外力对分子结构及其激发态的影响。这篇文章http://sobereva.com/594说在Gaussian程序中不支持直接给原子加外力,所以我想利用文章中3.1中柔性扫描的方式来模拟外力(假设力会改变原子间的键长)。

我现在的简单尝试为:
对构建的体系(包含H、O、Si、Er元素。使用的是混合基组,H O Si 使用6-31+G*基组,Er使用ECP57赝势基组)进行了opt+freq的优化
在优化基态几何结构的基础上,改变某两个原子的键长进行柔性扫描,再把扫描的每个点的构型取出来,分别计算单点能,用TDDFT进行激发态的计算,用来对比不同键长下激发态的变化。

有以下几个问题:
1.柔性扫描进行的限制性优化,得到的每个点是改变键长后优化好的基态几何结构吗?
2.把扫描的每个点的构型取出来分别计算单点能,用TDDFT进行激发态计算,这样的做法是否正确,每个点算出来的激发态是否有参考意义?
3.Gaussian中有其他的对分子施加力/力场同时进行opt优化的方式吗?想分析施加力/力场后激发态的变化。

刚接触Gaussian,请各位老师指点,非常感谢!


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zjxitcc    时间: 2023-7-6 15:11
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-7-6 15:31 编辑

1. 如果你做的是基态DFT下的柔性扫描,自然得到的是 给定限制下的 基态几何结构。
2. 思路正确。但计算结果有时有意义,有时没有意义。这里面要注意三点:
(1)键长较长时,体系多组态/多参考态特征增强,以单重态为例,很可能会发现基态RDFT波函数不稳定,存在能量更低的对称破缺UDFT稳定解,能量低于你直接用程序傻瓜式算出的能量。同时由于UDFT存在自旋污染,在此基础上做TDDFT计算,每个态都有自旋污染,难以分辨哪个是单重态激发态,哪个是三重态激发态,对研究问题几乎没有帮助。
(2)最好往目标原子间距离缩短的方向进行扫描,而非反之。
(3)结构被限制了,原子受力不为0,直接freq频率分析出来的热力学量没有意义,不要拿它讨论问题。
3. Gaussian中坐标限制有多种方式:(1)-1/0方式;(2)opt=modredundant方式;(3)GIC方式。根据研究目的确定选用合适的。
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chenshi    时间: 2023-7-6 15:58
zjxitcc 发表于 2023-7-6 15:11
1. 如果你做的是基态DFT下的柔性扫描,自然得到的是 给定限制下的 基态几何结构。
2. 思路正确。但计算结 ...

非常感谢老师的解答,对于问题1和2,我可以理解为非能量最低点结构也可以进行激发态计算吗?因为随着键长增加/减少,柔性扫描出来的scan结果,结构能量相比于一开始几何优化的基态结构的能量会增加。

还有两个小问题:
2(2)在做柔性扫描时,给的语句为:B 11 18 S 20 0.005000 (原子11和18的键长扫描20步,每步增加0.005),怎么样可以往缩短的方向扫描呢?将0.005改为 -0.005吗?
2 (3) 取柔性扫描每个点进行单电能,在multiwfn进行态密度和电子差分图的分析是有意义的吗?
请老师指点,非常感谢~
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zjxitcc    时间: 2023-7-6 16:25
可以进行。就是取负号。有意义。
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chenshi    时间: 2023-7-6 18:20
zjxitcc 发表于 2023-7-6 16:25
可以进行。就是取负号。有意义。

好的老师,非常感谢
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chenshi    时间: 2023-7-7 11:25
zjxitcc 发表于 2023-7-6 16:25
可以进行。就是取负号。有意义。

打扰老师,昨天又想到一个问题:
柔性扫描每个点的构型取出来可以进行激发态的计算,那扫描后每个点的荧光发射可以计算吗?这篇文章里http://sobereva.com/314提到荧光计算是要在优化的S1结构下计算S1->S0的垂直发射能以及对应的振子强度。

柔性扫描后(假设外力改变键长)的点位已经不是基态能量最低点了,根据老师之前的回复,我把柔性扫描出来的点,当做是给定条件下已经优化好的基态几何结构,这样我把柔性扫描每个点的构型取出来作为输入文件,再进行TD opt的计算,算是在做S1态的优化吗?这样算柔性扫描后每个点的荧光发射正确吗?




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