计算化学公社

标题: VASP6.4.1 GPU版本遇到的real time 是cpu time的二倍问题 [打印本页]

作者
Author: weitao 时间: 2023-7-6 16:30
标题: VASP6.4.1 GPU版本遇到的real time 是cpu time的二倍问题
本帖最后由 weitao 于 2023-7-6 16:37 编辑

使用A100-80G 做VASP6.4.1的GPU加速，经常会遇到real time是cpu time的二倍，百思不得其解，尚未找到能修正这个问题的解决方式。
grep LOOP OUTCAR
   LOOP:  cpu time    12.4413: real time    24.8912
   LOOP:  cpu time    11.7627: real time    23.5531
   LOOP:  cpu time    11.7497: real time    23.5035
   LOOP:  cpu time    12.5075: real time    25.0248
   LOOP:  cpu time    14.9064: real time    29.8451
   LOOP:  cpu time    16.9084: real time    33.8327
   LOOP:  cpu time    16.7066: real time    33.4186
makefile.include INCAR和提交脚本如附件所示

作者
Author: 乐平 时间: 2023-7-6 22:11
我遇到的问题更诡异，GPU 版的 VASP 跑了几步电子步之后 GPU 开始摸鱼，负载就降到 0 。然后就切换到 CPU 上运行。

由于节点上只有一张 A100 40GB 的GPU，作业脚本里只能设置 #SBATCH --ntasks-per-node=1，也就是只有一个 CPU 接着运行，导致每个电子步从 GPU 的 15 s 的耗时超过 10000 秒……

作者
Author: johnnywow 时间: 2023-7-9 22:04
集群的硬盘配置是怎么样的啊，会不会是IO的问题。

作者
Author: 不能左右 时间: 2023-10-27 14:27
你的主板是不是可以插多张GPU卡，比如是8卡或者10卡的主板？那么每颗CPU下面会连一颗icswitch芯片，然后每个icSwitch芯片会连4个或者5个pcie设备，这种cpu gpu非直连架构的机器跑vasp这种高内存显存访问频率的程序会非常拉胯。

作者
Author: qty 时间: 2023-12-24 20:04
我也遇到了这个问题，换了数学库什么的都没有效果。而且所有时间乘2实在是太诡异了。。楼主解决了吗

作者
Author: qty 时间: 2023-12-27 09:46

qty 发表于 2023-12-24 20:04
我也遇到了这个问题，换了数学库什么的都没有效果。而且所有时间乘2实在是太诡异了。。楼主解决了吗

我解决了，把显卡查到最上面那个槽就好了

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)