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标题: IGMH方法的弱相互作用可视图中范德华作用如何判断是吸引力还是排斥力? [打印本页]

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大头攒毛    时间: 2023-7-6 17:09
标题: IGMH方法的弱相互作用可视图中范德华作用如何判断是吸引力还是排斥力?
各位老师好,最近在研读sob老师关于IGMH的博文,我用这种理论尝试画了一下弱相互作用着色图(血红素+C6链+苯环),但是根据色散刻度表发现:无法判断中间的绿色的等值面所表示的范德华相互作用是吸引的还是相互排斥的?请教各位老师,一般想要说明空间位阻的话,要用哪种弱相互作用的理论来说明?如下附上着色图和一些vmd的设置图。

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sobereva    时间: 2023-7-7 11:04
此问题跟Gaussian/gview毫无关系,别选Gaussian/gview分类,并且看清楚板块再发帖。这次给你移动了,以后注意
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sobereva    时间: 2023-7-7 11:06
如果结构经过优化,显然只可能体现范德华吸引作用。等值面上既没有偏红的地方,又没有其它原因导致分子位置无法自发调节,自然不可能有位阻。要从IGMH基本思想上理解,仔细阅读下文

使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表!
http://sobereva.com/667http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html



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大头攒毛    时间: 2023-7-7 23:07
谢谢sob老师




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