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标题: 溶液中重金属吸附模拟时，吸附剂去质子化，体系电荷平衡问题 [打印本页]

作者
Author: KCM@SHU 时间: 2023-7-7 03:51
标题: 溶液中重金属吸附模拟时，吸附剂去质子化，体系电荷平衡问题
各位老师，我想问一下最近我在做溶液金属离子吸附的分子动力学吸附模拟，我在做吸附剂去质子化对吸附的影响这一步时，我把材料上20个官能团去质子化了，为了保证体系的电荷平衡我在溶液中引入了20个钠离子，但是这时候计算刚跑起来就会出现bond missing的报错，但是如果我不加额外的钠离子就不会报错可以正常跑，我想问一下这种情况对于吸附剂去质子化后引入的平衡电荷是不是要进行什么特殊处理来避免其报错呢？呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-7 10:26
没具体结构文件、拓扑文件、输出文件没法说
加钠离子不影响成键关系，跟那个报错没直接关系

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