计算化学公社

标题: 求助：蛋白质模拟中水分子排列结果 [打印本页]

作者
Author: xjw 时间: 2023-7-9 10:03
标题: 求助：蛋白质模拟中水分子排列结果
老师好，我想问问gromacs可以得到下图的结果嘛？即水分子的排列

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-9 10:08
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

连theta怎么定义的都不说

作者
Author: xjw 时间: 2023-7-10 19:37

sobereva 发表于 2023-7-9 10:08
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http:// ...

感谢老师回复，我去看了下文章这个theta的定义方式如下图

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-11 11:02

xjw 发表于 2023-7-10 19:37
感谢老师回复，我去看了下文章这个theta的定义方式如下图

gmx自带的程序我想不起来有能干这个的，需要自己写分析脚本

作者
Author: xjw 时间: 2023-7-12 10:43

sobereva 发表于 2023-7-11 11:02
gmx自带的程序我想不起来有能干这个的，需要自己写分析脚本

好的，谢谢老师

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