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标题: 求助：gmx distance应该如何测定肽段上氧原子和溶液中钙离子的距离 [打印本页]

作者
Author: Ajl 时间: 2023-7-10 19:38
标题: 求助：gmx distance应该如何测定肽段上氧原子和溶液中钙离子的距离
如题：我的体系中有一个肽段和六个钙离子，我想计算肽段ASP氨基酸上的羧基氧和钙离子的距离，但是钙离子体系中有六个，这一点应该如何写命令呢，新手请各位老师指教

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-11 12:39
看不懂你想得到什么，与各个Ca的距离还是平均距离

作者
Author: Ajl 时间: 2023-7-11 14:13

sobereva 发表于 2023-7-11 12:39
看不懂你想得到什么，与各个Ca的距离还是平均距离

我目前的想法是把与每个Ca的平均距离都计算出来，然后再取平均值这样可以吗

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-11 14:29

Ajl 发表于 2023-7-11 14:13
我目前的想法是把与每个Ca的平均距离都计算出来，然后再取平均值这样可以吗

可以

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