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标题: 请问在使用molclus做构象搜索时能用gaussian优化好的结构直接调用ORCA计算自由能吗？ [打印本页]
作者
Author: UTM    时间: 2023-7-11 02:27
标题: 请问在使用molclus做构象搜索时能用gaussian优化好的结构直接调用ORCA计算自由能吗？
如题，在sob老师的“使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索”一文中我已经顺利的做完了前三步。在第四步“用Molclus调用Gaussian和ORCA得到溶剂环境下的高精度自由能”的时候我想在计算不同溶剂环境中的自由能的时候用算第一个溶剂时优化完的gaussian结构直接在ORCA中使用不同的溶剂模型计算。但是如果手动将gaussian的结构提取出来用ORCA算的话又没法得到isomers.xyz，需要手动算出自由能、排序、归簇。请问能够在进行这一步的时候跳过gaussian计算的部分直接用已知的结构带入ORCA去算自由能吗？


作者
Author: sobereva    时间: 2023-7-11 17:30
我刚刚在Molclus官网http://www.keinsci.com/research/molclus.html里添加了1.10版，settings.ini里ibkout新增-1选项。对于调用Gaussian或ORCA的情况，ibkout设为-1时如果发现当前目录下有以前备份好的文件（如gau00002.out、orca00005.out），则Molclus会直接读里面的数据而不会重新计算（有template_SP.inp的时候照样会调用ORCA算单点）。
作者
Author: UTM    时间: 2023-7-12 01:14
sobereva 发表于 2023-7-11 17:30
我刚刚在Molclus官网http://www.keinsci.com/research/molclus.html里添加了1.10版，settings.ini里ibkout ...

谢谢sob老师！这功能太方便了



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