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标题: cp2k 做AIMD电子步时间突然暴涨 [打印本页]

作者
Author: Weldingspock 时间: 2023-7-11 18:24
标题: cp2k 做AIMD电子步时间突然暴涨
各位老师好，我用cp2k做AIMD时会出现电子步时间突然暴涨的情况，经测试在其他电脑/服务器上均没问题。只有在一台电脑上会出现这个问题，并且2022.2和2023.1版本都会出现同样问题。更改输入文件的收敛标准也会出同样的问题。不知道是电脑的哪个部分出了问题，现在是毫无头绪不知从何查起。附上我的输入和输出文件。衷心希望各位老师能够指点。

作者
Author: yjb 时间: 2023-7-12 09:12
看一下输出的轨迹文件是不是发生了很大的结构变动。

作者
Author: Weldingspock 时间: 2023-7-12 09:29

yjb 发表于 2023-7-12 09:12
看一下输出的轨迹文件是不是发生了很大的结构变动。

没有，因为在第一个step就出现了这种情况

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-12 09:37
既然其它机子上都没问题，那就是这个机子上编译、运行环境或者硬件的问题
确保机子里没有其它明显占CPU的任务捣乱。并且检验给不同并行核数时的情况

作者
Author: Weldingspock 时间: 2023-7-12 20:52

sobereva 发表于 2023-7-12 09:37
既然其它机子上都没问题，那就是这个机子上编译、运行环境或者硬件的问题
确保机子里没有其它明显占CPU的 ...

并行核数越少，电子步暴涨出现的步数就越迟。

然后我手贱设置了export OMP_NUM_THREADS=1, export TF_INTRA_OP_PARALLELISM=0, export TF_INTER_OP_PARALLELISM=0之后，从第一个电子步开始时间就原来的几十倍。请问一下sob老师有什么排除故障的方法吗，或者是这种情况下重装系统会不会变好？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-13 05:59

Weldingspock 发表于 2023-7-12 20:52
并行核数越少，电子步暴涨出现的步数就越迟。然后我手贱设置了export OMP_NUM_THREADS=1, export TF_ ...

可以使用与之前不同的CP2K版本和MPI库编译试试
如果系统里没什么重要东西，重装系统不麻烦，也可以试试，不过大概率这个没什么用

作者
Author: Weldingspock 时间: 2023-7-13 09:52

sobereva 发表于 2023-7-13 05:59
可以使用与之前不同的CP2K版本和MPI库编译试试
如果系统里没什么重要东西，重装系统不麻烦，也可以试试 ...

好的，我试一试，谢谢老师

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