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标题: 使用服务器Orca计算时任务由4核变为单核 [打印本页]

作者
Author: 升腾 时间: 2016-8-7 09:46
标题: 使用服务器Orca计算时任务由4核变为单核
您好，我先按照http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1894&highlight=orca成功安装了openmpi文件与Orca。指定4核进行计算，刚开始2分钟是4核运算的，之后任务自己变成了单核，这是什么情况呢。
下面是输入命令：
!pal4
!BLYP D3 GCP(DFT/SVP) def2-SVP def2-SVP/j Opt nopop
%maxcore 1000
*xyz 0 1
C 1.84354935 -2.28206401 0.21451061
~~~
*

作者
Author: sobereva 时间: 2016-8-7 12:32
信息量不足难以判断。你看看变成单核的时候算到什么地方了，有些模块本身也没做并行化

作者
Author: 升腾 时间: 2016-8-7 13:15
嗯嗯，刚刚接触orca,提交了其他命令可以多核运算，可能是输入命令的问题，我再自己研究一下。thanks Sob 老师。

作者
Author: 升腾 时间: 2016-8-7 17:14
老师您好，经过反复调试发现在计算过程中Orca首先调用了Orca_scf_mpi程序，此过程为4核运算；接下来调用Orca_scfgrad_mpi程序，任务开始时是4核，运行时间约为1分钟，变成单核运行。是这个模块没有做并行化吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-8-7 22:30

升腾发表于 2016-8-7 17:14
老师您好，经过反复调试发现在计算过程中Orca首先调用了Orca_scf_mpi程序，此过程为4核运算；接下来调用Orc ...

Orca_scf_grad_mpi调用完之后，算下一步，又重新变回四核并行没有？

作者
Author: 升腾 时间: 2016-8-8 08:44
老师，程序依然在单核运行Orca_scfgrad_mpi，让他再算会瞧瞧。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-8-8 13:13

升腾发表于 2016-8-8 08:44
老师，程序依然在单核运行Orca_scfgrad_mpi，让他再算会瞧瞧。

当前输出文件里信息输出到哪里了？如果一直卡在gcp梯度那里，是老版本bug。

作者
Author: 升腾 时间: 2016-8-8 16:15
老师依然在使用单核运行Orca_scfgrad_mpi，这个版本是3.01版，之前下载您上传的3.02版2次，解压时都是遇到文件归档失败问题。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-8-8 22:41

升腾发表于 2016-8-8 16:15
老师依然在使用单核运行Orca_scfgrad_mpi，这个版本是3.01版，之前下载您上传的3.02版2次，解压时都是遇到 ...

改用3.0.3。3.0.1用gcp用并行优化的时候会卡住，3.0.3没这个问题。
我传的肯定没问题，估计是你下载不完整所致

作者
Author: 升腾 时间: 2016-8-9 15:41
嗯嗯，好的老师。

作者
Author: lao7 时间: 2016-8-29 15:02
只是一个间断过程，短时期内软件在单核分析资源。过会有转变成多核计算了，放心吧，你这种问题出现概率很小，如果被你发现了，你就是发现个大BUG

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