计算化学公社

标题: 报错求助：[mpiexec@a620] set_default_values (../../ui/mpich/utils.c:4663): [打印本页]

作者
Author: Hillary 时间: 2023-7-16 10:11
标题: 报错求助：[mpiexec@a620] set_default_values (../../ui/mpich/utils.c:4663):
本帖最后由 Hillary 于 2023-7-16 16:36 编辑

计算任务一投入就出现这种报错，请问各位老师这是哪方面的问题？（计算任务是结构的优化）

作者
Author: wypkdhd 时间: 2023-7-17 17:50
vasp版本是啥？另外，提任务用的是脚本还是是啥？请输入which mpiexec 和which ifort 截图返回值。

作者
Author: Hillary 时间: 2023-8-1 12:55
本帖最后由 Hillary 于 2023-8-1 12:57 编辑

C:\Users\ztc18\Pictures\联想截图

作者
Author: Hillary 时间: 2023-8-1 12:55

wypkdhd 发表于 2023-7-17 17:50
vasp版本是啥？另外，提任务用的是脚本还是是啥？请输入which mpiexec 和which ifort 截图返回值。

是这个样子的，老师

作者
Author: wypkdhd 时间: 2023-8-1 16:31

Hillary 发表于 2023-8-1 12:55
是这个样子的，老师

vasp版本是啥，提任务命令是啥。

作者
Author: Hillary 时间: 2023-8-1 18:00

wypkdhd 发表于 2023-8-1 16:31
vasp版本是啥，提任务命令是啥。

版本是 vasp.5.4.1，提交任务的命令是qsub vasp.pbs

作者
Author: wypkdhd 时间: 2023-8-1 19:45

Hillary 发表于 2023-8-1 18:00
版本是 vasp.5.4.1，提交任务的命令是qsub vasp.pbs

vasp.pbs 内容贴出来。是所有任务都这样吗？

作者
Author: Hillary 时间: 2023-8-1 20:03

wypkdhd 发表于 2023-8-1 19:45
vasp.pbs 内容贴出来。是所有任务都这样吗？

不是，有的时候是这个样子，大部分时候是出现报错：/opt/gridview//pbs/dispatcher/mom_priv/jobs/6046.a620.SC: line 25: syntax error near unexpected token `done'
/opt/gridview//pbs/dispatcher/mom_priv/jobs/6046.a620.SC: line 25: `done'

作者
Author: wypkdhd 时间: 2023-8-2 08:58

Hillary 发表于 2023-8-1 20:03
不是，有的时候是这个样子，大部分时候是出现报错：/opt/gridview//pbs/dispatcher/mom_priv/jobs/6046.a ...

你这脚本也太复杂了，我觉得很多没必要。如果你没有用module模块加载intelmpi，你应该在脚本里加export路径的。但是你which mpiexec 和 which ifot 都有返回值，证明你的intel环境是一直存在的，所以我不知道你为啥会出现最开始的那个问题。

不好意思，我能力不足。

你这个问题应该联系下超算管理员的。你既然用集群超算了，总不会一个负责人都没把？别人应该也有用vasp的，可以问问。

我个人觉得，你把脚本里面的done删了吧。说实话，mpirun那一行我没看懂，但是没报错就没事。

作者
Author: Hillary 时间: 2023-8-2 09:57

wypkdhd 发表于 2023-8-2 08:58
你这脚本也太复杂了，我觉得很多没必要。如果你没有用module模块加载intelmpi，你应该在脚本里加export路 ...

害！我就是计化小白一个，脚本其实也都看不太懂那个，非常感谢老师的指导，想再咨询一下老师，如果想能够自己分析一些报错或者脚本的编辑，我需要从哪方面入手补呢？再次感谢！

作者
Author: wypkdhd 时间: 2023-8-2 13:31

Hillary 发表于 2023-8-2 09:57
害！我就是计化小白一个，脚本其实也都看不太懂那个，非常感谢老师的指导，想再咨询一下老师，如果想能够 ...

没啥需要补的，就是百度搜关键词，必应搜关键词，然后什么pbs脚本案例，B站上linux语言入门。要搞得很多，还不如遇到问题百度必应解决问题。

作者
Author: Hillary 时间: 2023-8-3 09:42

wypkdhd 发表于 2023-8-2 13:31
没啥需要补的，就是百度搜关键词，必应搜关键词，然后什么pbs脚本案例，B站上linux语言入门。要搞得很多 ...

明白了，谢谢！

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