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标题: 如何检查几何优化分子处于全局最小状态 [打印本页]

作者
Author: han- 时间: 2023-7-17 20:59
标题: 如何检查几何优化分子处于全局最小状态
各位老师，请问在使用Gaussian时，如何检查几何优化分子处于全局最小状态？

作者
Author: ChemG 时间: 2023-7-17 21:03
看社长的这篇博文，1. 跑动力学一段时间取一帧去分析；2. 构想搜索；3. 如果很简单的分子/构型自己把几种可能构型优化一下，比较获得的电子能量或者自由能，越低越稳定。
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-20 12:57
成键方式典型的刚性分子，诸如苯，凭常识就能判断

柔性分子，需要考虑分子内弱相互作用、位阻等因素判断。拿不准就必须做构象搜索，看以下文章了解相关知识，以及怎么用molclus做构象搜索
根据Boltzmann分布计算分子不同构象所占比例
http://sobereva.com/165
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
gentor：扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

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