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标题: 求助大家，审稿人说固定的石墨烯影响水分子的运动 [打印本页]

作者
Author: 466468213 时间: 2023-7-18 14:17
标题: 求助大家，审稿人说固定的石墨烯影响水分子的运动
审稿意见求助
体系描述：我使用gromacs模拟了石墨烯表面水分子的运动，周期性边界条件是二维的，nvt系综，统计了水分子的msd曲线以及vanhove方程，在这个过程中石墨烯是固定的，使用了freeze命令。
审稿人意见：Frozen graphite (T=0) can have unnatural effects on water motions near the interface. The authors need to show that verifications.

请问大家知道这种问题怎么验证吗，小弟在此先谢过各位大佬，希望不吝赐教。

作者
Author: pal 时间: 2023-7-18 14:26
石墨烯本身是柔性的，很容易产生褶皱，非周期性的只固定边界呗

作者
Author: 466468213 时间: 2023-7-18 15:06

pal 发表于 2023-7-18 14:26
石墨烯本身是柔性的，很容易产生褶皱，非周期性的只固定边界呗

你好，我使用的是周期性的条件，石墨烯都是连在一起的，确实是不固定合理，头疼

作者
Author: 466468213 时间: 2023-7-18 15:07

466468213 发表于 2023-7-18 15:06
你好，我使用的是周期性的条件，石墨烯都是连在一起的，确实是不固定合理，头疼

看审稿人的建议可能他考虑的不是柔性和刚性的问题，可能他觉得固定组温度是0不合理

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-20 13:21
二维周期性本来就没必要对石墨烯做freeze。去掉freeze，重新算这些量。如果差异大，以无freeze的为准

作者
Author: 466468213 时间: 2023-7-20 19:56

sobereva 发表于 2023-7-20 13:21
二维周期性本来就没必要对石墨烯做freeze。去掉freeze，重新算这些量。如果差异大，以无freeze的为准

谢谢社长，我之前看我做的这个方向的文献都是固定的，当时没多想，就固定住了，这下可麻烦大了

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