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标题: 请教amber的rst文件格式 [打印本页]

作者
Author: alystone 时间: 2016-8-8 12:22
标题: 请教amber的rst文件格式
我跑了一个amber中的动力学，发现生成的rst文件格式和默认的不一样。
请问这种格式怎么用vmd打开？
“
%VERSION VERSION_STAMP = V0001.000 DATE = 04/29/16 14:03:53
%FLAG TITLE
%FORMAT(a)
solvated
%FLAG ATOMIC_COORDS_SIMULATION_TIME
%FORMAT(E16.8)
0.00000000E+00
%FLAG ATOMIC_COORDS_NUM_LIST
%FORMAT(i8)
19950
%FLAG ATOMIC_COORDS_LIST
%COMMENT dimension = (3,19950)
%FORMAT(3e20.12)
-0.109130000000E+02 -0.150800000000E+02 -0.236120000000E+02
-0.116300000000E+02 -0.165630000000E+02 -0.236370000000E+02
-0.108010000000E+02 -0.161060000000E+02 -0.223210000000E+02
-0.113770000000E+02 -0.157800000000E+02 -0.230690000000E+02
-0.126500000000E+02 -0.152890000000E+02 -0.225220000000E+02
-0.125870000000E+02 -0.151990000000E+02 -0.214440000000E+02
-0.131440000000E+02 -0.140460000000E+02 -0.232630000000E+02
-0.142480000000E+02 -0.141050000000E+02 -0.233790000000E+02
-0.129260000000E+02 -0.131220000000E+02 -0.226840000000E+02

…………
”

作者
Author: ruanyang 时间: 2016-8-8 16:06
5 readxst and writexst – Handling XST files
Syntax
pbc readxst xstfile [options…]
pbc writexst xstfile [options…]

Description
Read/write the unit cell information from an XST or XSC file.

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