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标题: QST2找过渡态问题 [打印本页]

作者
Author: xujian 时间: 2016-8-8 16:53
标题: QST2找过渡态问题
请问老师，为什么QST2得到的过渡态走IRC发现却不是输入的QST2中反应物和生成物的过渡态，这是什么原因？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-8-8 22:52
只有你给的反应物和产物结构和实际的那个基元反应的反应物和产物结构基本一致，而且QST2方法对当前恰好适用的时候，拿得到的过渡态走IRC才能得到一开始给的反应物和产物。

如果一开始反应物和产物就没给对，比如和实际结构偏差很大，或者不是基元反应的而是复合反应的始末两端的结构，或者QST2由于算法本身不怎么样对当前情况恰好不好（比如自动确定的过渡态初猜结构不合适导致收敛到了其它反应的过渡态去），都会出现你的情况。

作者
Author: xujian 时间: 2016-8-9 08:40
谢谢sob老师，还想请教您一下，走完IRC后，IRC一端的结构保存下来进行优化，正常结束得到的结构与保存的结构相差很大，应该以哪个结构为准？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-8-9 13:57

xujian 发表于 2016-8-9 08:40
谢谢sob老师，还想请教您一下，走完IRC后，IRC一端的结构保存下来进行优化，正常结束得到的结构与保存的结 ...

你是指IRC一端取的结构，优化完了和优化前差异大？
如果是这样，说明IRC跑得不够长，末端离极小点还有一段距离。亦有可能由于优化算法的原因，在默认的步长上限下一下子跑到别的极小点去了。

作者
Author: xujian 时间: 2016-8-9 16:41
谢谢sob老师。再向您讨教一下，如何才能确保异构体之间相互转化的过渡态全部找到呢，是根据经验吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-8-10 00:11

xujian 发表于 2016-8-9 16:41
谢谢sob老师。再向您讨教一下，如何才能确保异构体之间相互转化的过渡态全部找到呢，是根据经验吗？

是

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