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标题: CP2K过渡态搜寻,没有找到过渡态峰的一个困惑? [打印本页]

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lao7    时间: 2023-7-26 12:06
标题: CP2K过渡态搜寻,没有找到过渡态峰的一个困惑?
本帖最后由 lao7 于 2023-7-26 12:11 编辑

各位老师大家好!
体系是:二氧化碳在铜簇表面发生的电化学催化还原,我利用cp2k计算过渡态。设置是按照multiwfn中的-7功能,即“searching transition state (dimer algorithm)”。计算的输出out结果,我使用grep提取了“total force_eval (QS) energy [a.u.]”的数据。

问题是:当我打开能量变化作图时,图形结构类似于楼梯一样(中间1个平阶梯,没有峰)的图,并没有出现典型的山峰的峰值过渡态。我在怀疑是不是我设置有问题(看到结果感觉整个过程就像在优化,而不是过渡态)?因为我查询有些用什么CI-NEB,还设置什么band。请用过的告知我一下,我这个原设置有问题吗?或许压根催化条件下就没有峰值过渡态?
谢谢各位解答疑惑!


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sobereva    时间: 2023-7-26 13:52
这种问题显然得结合优化轨迹来看,否则必然会被蒙在鼓里
在有过渡态的前提下,dimer是否能成功找到过渡态取决于dimer初始位置和初始朝向
CI-NEB和dimer的原理和设置截然不同,做dimer没band的事。
如果对过渡态的结构心里没数,建议先把反应物和产物优化出来,然后做CI-NEB。CI-NEB的成功几率更高,而且给出的信息更充分和直观

作者
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lao7    时间: 2023-7-26 21:49
sobereva 发表于 2023-7-26 13:52
这种问题显然得结合优化轨迹来看,否则必然会被蒙在鼓里
在有过渡态的前提下,dimer是否能成功找到过渡态 ...

谢谢!您说的优化轨迹,指的是随着优化,观察结构的变化情况是吗?
作者
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sobereva    时间: 2023-7-26 23:47
lao7 发表于 2023-7-26 21:49
谢谢!您说的优化轨迹,指的是随着优化,观察结构的变化情况是吗?






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