计算化学公社

标题: vmd 中 pdb 文件部分残基不显示 [打印本页]

作者
Author: molly85 时间: 2023-7-27 09:38
标题: vmd 中 pdb 文件部分残基不显示
用amber里的cpptraj 跑出来的pdb 文件卡通形式不显示，或者只显示出一部分，这个问题怎么解决呢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-27 11:28
确保pdb文件里原子名合理、符合IUPAC规范，否则没法识别二级结构

作者
Author: molly85 时间: 2023-7-28 10:34
谢谢啦，不过我检查了一边，原子命名无误。
但是直接用pdb 的转化文件 top,crd直接在vmd里展示，又可以看到卡通。

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