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标题: 分子对接批量处理蛋白问题 [打印本页]

作者
Author: gky_buct 时间: 2023-7-28 15:39
标题: 分子对接批量处理蛋白问题
我在做反向分子对接，需要处理大量蛋白。想请问各位有没有什么方法可以批量把蛋白中的水分子、杂分子去除，只保留蛋白链。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-7-28 22:53
写个VMD脚本，只保留蛋白部分
然后写个shell脚本，循环每个蛋白质pdb，都调用VMD载入脚本进行处理

作者
Author: gky_buct 时间: 2023-7-30 17:41

sobereva 发表于 2023-7-28 22:53
写个VMD脚本，只保留蛋白部分
然后写个shell脚本，循环每个蛋白质pdb，都调用VMD载入脚本进行处理

明白，我去研究下

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