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标题: 求助:md进行中途报错 [打印本页]

作者
Author:
TL131242    时间: 2023-7-29 11:17
标题: 求助:md进行中途报错
1 of the 8430 bonded interactions could not be calculated because some atoms
involved moved further apart than the multi-body cut-off distance (0.832653
nm) or the two-body cut-off distance (1.74543 nm), see option -rdd, for pairs
and tabulated bonds also see option -ddcheck

md进行了一会开始报错,请问这种错误是蛋白结构的问题吗,需要优化吗?
以下是mdp文件及输入gro文件
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作者
Author:
sobereva    时间: 2023-7-29 12:48
参考http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8处理
作者
Author:
TL131242    时间: 2023-7-29 15:09
sobereva 发表于 2023-7-29 12:48
参考http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8处理

感谢卢老师




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