计算化学公社
标题: Multiwfn导入不同来源的相同结构cif,出现严重不一致原因咨询 [打印本页]
作者Author: sigma-jlu 时间: 2023-7-30 13:03
标题: Multiwfn导入不同来源的相同结构cif,出现严重不一致原因咨询
multiwfn3.8_dev_bin_win64版本,开始运行输入cif文件名称后,依次输入100,7,1,enter,0,输出cp2k的输入文件。
使用icsd和materProject两个渠道得到的a-Fe2O3 Hematite的cif文件,从空间群、单胞参数和原子坐标来看,二者并无大体不同,但在inp文件中,两个cif输出的原子坐标反差极大,mp渠道的有12个铁原子18个氧原子,但icsd的cif对应了12个铁原子和30个氧原子。
如此严重的不一致,不知这是multiwfn的bug,还是不同来源cif规范的bug?
两对输入输出文件已上传供排查。
作者Author: sobereva 时间: 2023-7-30 14:11
说multiwfn3.8_dev_bin_win64没意义,说清楚具体更新日期。multiwfn3.8_dev_bin_win64都更新过至少200次了
作者Author: sigma-jlu 时间: 2023-7-30 15:34
参考一个自动更新mua的脚本(http://bbs.keinsci.com/thread-20052-1-1.html)
更新时间截图,exe文件的时间点是2023-03-30。
不知道这个自动更新操作有什么重要遗漏?
作者Author: anson 时间: 2023-7-30 16:38
Development version: 3.8(dev) Last update: 2023-Jul-28
啊哈哈哈,这4个月滚动更新的版本都不下50次了
作者Author: sigma-jlu 时间: 2023-7-30 18:34
抱歉,因为我没有更新multiwfn的版本,浪费了您的宝贵时间在无意义的问题上。
我刚刚在http://sobereva.com/multiwfn/ 将程序更新到28Jul. 2023,发现inp文件中icsd的cif文件输入产生的原子坐标信息多了18行。
更新版本的截图以及输出文件均呈上,如有遗漏请指正。
作者Author: anson 时间: 2023-7-30 19:16
应该不是Multiwfn的问题。
我用gv6分别打开两个文件,也是一个12Fe30O、一个12Fe18O。估计是原.cif文件来源不同,构建结构的方式不一致的问题。
作者Author: sigma-jlu 时间: 2023-7-31 09:13
看cif文件内部信息吧,如果我能一眼看出哪里有问题,我也不会发帖咨询。
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