计算化学公社

标题: 通过传真获取CFOUR授权的方法 [打印本页]

作者
Author: goldNAN 时间: 2023-8-1 11:58
标题: 通过传真获取CFOUR授权的方法
Cfour是一个以做耦合簇见长的从头算程序，使用需要获取开发者的授权。
https://cfour.uni-mainz.de/cfour/index.php?n=Main.Download 中提到签过名的授权文件（[size=14.6667px]license agreement）可以通过普通的邮件寄到德国或者通过传真发送（[size=14.6667px]fax number: +49 6131 3923895）。前者略显麻烦，我使用了传真的方法。

[size=14.6667px]首先从[size=14.6667px]https://cfour.uni-mainz.de/cfour/index.php?n=Main.MainLicense?action=print下载空白的授权文件，然后打印、签名、扫描为PDF。
[size=14.6667px]然后在淘宝上找了个可以发国际传真的商家代发，一共4页，48块钱，可以开发票。

[size=14.6667px]发送日期2023年7月12日，收到开发者的邮件是[size=14.6667px]2023-07-19。一个星期搞定。
[size=14.6667px] 从网站上下载的安装包跟这个帖子里的13楼发的版本一样 [size=14.6667px]http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3018。
[size=14.6667px]安装方式与http://sobereva.com/150帖子里有一些差异，主要是新版本需要用到icpc（c++编译器）以及intel新版本的mkl库里没有libmkl_solver_ilp64.a[size=14.6667px]，安装并行版的步骤有2处不同

[size=14.6667px]编译mpich2时，./configure FC=ifort 替换成 ./configure FC=ifort CC=icc CXX=icpc
编译cfour时，编译参数换成 FC=ifort CC=icc CXX=icpc MPIFC=mpif90 ./configure --with-blas="$MKLPATH/libmkl_intel_ilp64.a -Wl,--start-group $MKLPATH/libmkl_intel_ilp64.a $MKLPATH/libmkl_intel_thread.a $MKLPATH/libmkl_core.a -Wl,--end-group -qopenmp -lpthread" --enable-mpi=mpich --with-mpirun="mpirun -np \$CFOUR_NUM_CORES" --with-exenodes="mpirun -np \$CFOUR_NUM_CORES" --prefix=/home/nxu/softwares/cfour_mpi

“CFOUR做耦合簇的效率号称很高，CCSD(T)计算对于高对称性体系比Gaussian快2、3倍是有的，结果相符也很好，但是无对称性体系下却并不总比Gaussian09快”。社长这句话一点问题都没有，对于大体系CFOUR可能很慢。此外，在集群上使用，计算目录最好放在slave node的本地硬盘里，使用master的共享硬盘计算速度会打很多折扣。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-1 12:10

作者
Author: wjc404 时间: 2023-8-1 19:20
本帖最后由 wjc404 于 2023-8-1 19:27 编辑

除了MP2/CCSD/CCSD(T)，CFOUR做其他级别的冻芯时的解析导数可能有BUG（比如优化收敛了但是频率任务出来的三个旋转频率明显不为零），不知道现在修复了没有。CCSD的效率与Gaussian相仿。另外算(T)时需要靠MPI才能较好地并行，此时如果不写ABCDTYPE=AOBASIS则磁盘容易爆。

作者
Author: goldNAN 时间: 2023-8-1 21:53
感觉比psi4省内存，对于水三聚体，同样CCSD(T)/aug-cc-pVTZ算一阶导数，psi4 256G内存不够用 cfour能算

作者
Author: goldNAN 时间: 2023-8-2 09:34

wjc404 发表于 2023-8-1 19:20
除了MP2/CCSD/CCSD(T)，CFOUR做其他级别的冻芯时的解析导数可能有BUG（比如优化收敛了但是频率任务出来的三 ...

意思就是MKL的那个核心数设为1？

作者
Author: chemjay 时间: 2023-9-13 15:21
急用一个CFOUR2.1版本，请问可以传一个给我吗？后续补上传真。邮箱502771094@@qq.com

作者
Author: LiHuaYu 时间: 2023-9-13 16:40

chemjay 发表于 2023-9-13 15:21
急用一个CFOUR2.1版本，请问可以传一个给我吗？后续补上传真。邮箱502771094@@qq.com

This might help
https://disk.yandex.ru/d/0BVrB7HEX5O4_w

作者
Author: beefly 时间: 2023-9-13 18:55

goldNAN 发表于 2023-8-1 21:53
感觉比psi4省内存，对于水三聚体，同样CCSD(T)/aug-cc-pVTZ算一阶导数，psi4 256G内存不够用 cfour能算

cfour的ccsd(t)比同类程序的效率高太多了（可能只有molpro和e^T的ccsd(t)效率更高一些）。我记得10年前在ccsd(t)/aug-cc-pvtz级别下优化C10H12的结构并计算频率。当时的硬件条件不行，用了全部的几十GB的内存，如果有几百GB，减少读写，效率会更高。其中最耗时的解析频率计算用了40多天，同时提交的数值频率一个月就完成了，应该是解析频率的硬盘读写太多了，导致不如数值频率快。

作者
Author: chemjay 时间: 2023-9-14 09:16
本帖最后由 chemjay 于 2023-9-14 09:31 编辑

谢谢

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