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标题: Multiwfn+VMD绘制静电势图，为什么做出来的图和标尺都对应正的？ [打印本页]

作者
Author: qyl 时间: 2023-8-1 16:09
标题: Multiwfn+VMD绘制静电势图，为什么做出来的图和标尺都对应正的？
想咨询一下，使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势图时，红色部分对应的电负性为负，为什么做出来的图和标尺都对应正的？把colorscale 里面的method改为RWB,分子中电负性为负的那一部分标尺显示仍然是正，是哪里的设置存在问题吗？

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作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-1 16:12
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “Multiwfn+VMD快速地绘制静电势图” 改了，以后务必注意，下次将删帖+扣分处理。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-1 16:27
色彩刻度轴体现的是静电势，而不是电负性，搞清楚画的是什么

明明色彩刻度轴正负部分都有，颜色也是红蓝都有，何来“做出来的图和标尺都对应正的”

作者
Author: qyl 时间: 2023-8-1 17:00

sobereva 发表于 2023-8-1 16:27
色彩刻度轴体现的是静电势，而不是电负性，搞清楚画的是什么

明明色彩刻度轴正负部分都有，颜色也是红蓝 ...

谢谢老师纠正，我下次注意。根据分子结构，红色那一步部分的结构，其静电势应该是负的，但用VMD默认的colorscale 里的method选项，画出来的那一部分表示的静电势是正的

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-1 17:23

qyl 发表于 2023-8-1 17:00
谢谢老师纠正，我下次注意。根据分子结构，红色那一步部分的结构，其静电势应该是负的，但用VMD默认的col ...

直接用下文的方法绘制的情况，色彩刻度默认用的BWR，蓝色必然对应负值。
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）
检查graphics - colors里当前用的color scale。如果VMD里设置没错，那就是你载入的静电势格点数据本身有问题，诸如用的是某些程序的Hartree势

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