计算化学公社

标题: 固定二面角进行柔性扫描，结构二面角发生了变化？ [打印本页]

作者
Author: yezhonghua 时间: 2016-8-16 09:12
标题: 固定二面角进行柔性扫描，结构二面角发生了变化？
计算一个结构，想固定其中的二面角进行基态的opt+freq 优化，二面角为60度。#p b3lyp/6-31g(d) opt=modredundant freq

（最后一行）
D 7 8 9 18 F

优化结束后，查看7 8 9 18 的二面角变成了61.9度。
冻结了二面角度应该优化前后不会发生变化，为什么会出现1.9度的变化？
谢谢哪位大神指点一下。

作者
Author: helpme 时间: 2016-8-16 10:32
你计算中固定的是 7 8 9 18，
但是你量的二面角实际上是 18 7 8 9（这个角度初始是60，结束是61.9，你帖子给的信息不准确）。

作者
Author: yezhonghua 时间: 2016-8-16 13:52

helpme 发表于 2016-8-16 10:32
你计算中固定的是 7 8 9 18，
但是你量的二面角实际上是 18 7 8 9（这个角度初始是60，结束是61.9，你帖子 ...

您的意思是我在gjf里面应该固定18 7 8 9？不是四个原子决定二面角的么？7 8 9 18和18 7 8 9 有区别么？
谢谢！

作者
Author: yezhonghua 时间: 2016-8-16 14:27

helpme 发表于 2016-8-16 10:32
你计算中固定的是 7 8 9 18，
但是你量的二面角实际上是 18 7 8 9（这个角度初始是60，结束是61.9，你帖子 ...

谢谢，gjf中18 7 8 9 的二面角也是60度。

作者
Author: helpme 时间: 2016-8-17 08:49
7 8 9 18和18 7 8 9 有区别么？
有很大的区别，完全不一样的两个二面角。
gjf中18 7 8 9 的二面角初始是60度没有错，但是你固定的是 7 8 9 18，所以优化后 18 7 8 9 变了，这个不能怪程序啊。

作者
Author: yezhonghua 时间: 2016-8-17 10:06

helpme 发表于 2016-8-17 08:49
7 8 9 18和18 7 8 9 有区别么？
有很大的区别，完全不一样的两个二面角。
gjf中18 7 8 9 的二面角初始是6 ...

谢谢，我再算一遍！

作者
Author: yezhonghua 时间: 2016-8-18 09:22

helpme 发表于 2016-8-17 08:49
7 8 9 18和18 7 8 9 有区别么？
有很大的区别，完全不一样的两个二面角。
gjf中18 7 8 9 的二面角初始是6 ...

谢谢，如你所说的一样，没有改变。非常感谢！

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