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标题: 二聚体跨膜蛋白在能量最小化出错,求助是蛋白结构问题吗? [打印本页]

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Author: Nancylee0416 时间: 2023-8-4 09:56
标题: 二聚体跨膜蛋白在能量最小化出错,求助是蛋白结构问题吗?
各位大佬，求助！在做跨膜蛋白的动力学模拟，蛋白结构是二聚体，用I-TASSER同源建模后，结合已有的pdb结构对部分Loop 区断链位置Val44-Lys64, Asp301-Leu328, Gly354-Tyr369补全，用spdbv补全缺失原子。进行模拟后在能量最小化的步骤一直各种报错，结合论坛中的帖子修改很多次依旧不成功，觉得还是蛋白结构的问题，但是不知如何入手检查结构错误。

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