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标题: gmx在NPT时出现( Warning: pressure scaling more than 1%) [打印本页]

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joke122    时间: 2023-8-4 22:30
标题: gmx在NPT时出现( Warning: pressure scaling more than 1%)
各位老师好,我在使用GMX进行NPT模拟时出现 Warning: pressure scaling more than 1%, mu: 3.28981e+10 3.28981e+10 3.28981e+10 的报错,计算无法进行下去,在通过查询之前的帖子,我也对tau_p进行了增大修改,但是结果没有变化,依然发生如上报错,请问改如何解决?

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sobereva    时间: 2023-8-5 01:36
用NVT跑一阵子看是否正常,至少由此先排除力场、拓扑文件不合理的可能性
如果NVT正常,VMD里观看轨迹的时候把盒子显示出来,仔细看NPT过程中盒子的变化弄清楚是什么情况
你的体系有很大真空区,不知道你想模拟什么。如果想模拟纯物质,应该把盒子塞得更满

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joke122    时间: 2023-8-5 11:41
sobereva 发表于 2023-8-5 01:36
用NVT跑一阵子看是否正常,至少由此先排除力场、拓扑文件不合理的可能性
如果NVT正常,VMD里观看轨迹的时 ...

谢谢老师回复,我去试试
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amdno    时间: 2024-7-11 17:59
joke122 发表于 2023-8-5 11:41
谢谢老师回复,我去试试

请问你是怎么解决的呢




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