计算化学公社

标题: 结构优化和单点能计算能量差别悬殊 [打印本页]

作者
Author:
ZPLLL    时间: 2023-8-7 21:02
标题: 结构优化和单点能计算能量差别悬殊
在优化EDTA-Fe(II)2-结构的过程中使用的是pbe1pbe泛函和混合基组(genecp(sdd;6-311g(d,p) ),能量为-1223.0980949 hartee;然而使用 b2plypd3/def2TZVPP 泛函和基组对其进行单点能计算时,能量为-2363.2416748 hartee。看过以前的帖子,说不同级别下绝对能量没有可比性《相同DFT不同基组计算的单点能差值较大 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com)》。但这个能量悬殊过大,想请教一下大佬这个能量可信吗?;此外,只有在基组为混合基组时(genecp(sdd;6-311g(d,p) ),能量为 -1223.0980949 hartee,在同一个泛函下更换了基组(pbe1pbe/def2tzvp em=gd3bj)之后能量为(-2362.8756447)与b2plypd3/def2TZVPP 的相差不大,能量的变化如此之大是因为赝势基组(sdd)的原因吗?
(, 下载次数 Times of downloads: 7)




作者
Author:
wzkchem5    时间: 2023-8-7 21:45
那叫SDD不叫SSD
参见https://mattermodeling.stackexch ... culations/9962#9962
作者
Author:
zjxitcc    时间: 2023-8-7 21:45
是因为赝势的原因。

至于是否可信,还有其他因素要考虑。比如
(1)你B2PLYPD3能量有没读错?看《谈谈该从Gaussian输出文件中的什么地方读电子能量》http://sobereva.com/488
(2)这个体系是开壳层的嘛?如果是,那波函数稳定性检查了没、自旋布居看了没?
作者
Author:
ZPLLL    时间: 2023-8-7 21:52
wzkchem5 发表于 2023-8-7 21:45
那叫SDD不叫SSD
参见https://mattermodeling.stackexchange.com/questions/9961/effective-core-potential ...

感谢指出书写问题,在计算中使用的是SDD,这里由于编辑的时候打顺手,下次还是要更细心。
作者
Author:
ZPLLL    时间: 2023-8-7 22:02
zjxitcc 发表于 2023-8-7 21:45
是因为赝势的原因。

至于是否可信,还有其他因素要考虑。比如

这个体系是开壳层,感谢解答并指出检查的方向;我后面去查看一下它的波函数和自旋布居
作者
Author:
ZPLLL    时间: 2023-8-7 22:50
zjxitcc 发表于 2023-8-7 21:45
是因为赝势的原因。

至于是否可信,还有其他因素要考虑。比如

您好,再请教一下。赝势基组与其它基组的单点能差别这么大,那么在计算单点能的过程中,是否能选用赝势基组来进行计算呢?
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-8-8 01:53
不要自己在标题里手写[gaussian]这种标签,这次给你改了,以后注意
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-8-8 02:12
ZPLLL 发表于 2023-8-7 22:50
您好,再请教一下。赝势基组与其它基组的单点能差别这么大,那么在计算单点能的过程中,是否能选用赝势基 ...

赝势基组不明确描述内核电子,而内核电子的能量又远比价层低得多,所以用不用赝势时能量的数量级都有很大不同
作者
Author:
ZPLLL    时间: 2023-8-8 10:58
sobereva 发表于 2023-8-8 02:12
赝势基组不明确描述内核电子,而内核电子的能量又远比价层低得多,所以用不用赝势时能量的数量级都有很大 ...

理解了,感谢老师的解答。
作者
Author:
ZPLLL    时间: 2023-8-8 10:59
sobereva 发表于 2023-8-8 01:53
不要自己在标题里手写[gaussian]这种标签,这次给你改了,以后注意

好的老师,下次我注意




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3