计算化学公社

标题: Gromacs是否可以做cpptraj内类似的组合聚类分析 [打印本页]

作者
Author: MMMine 时间: 2023-8-8 15:56
标题: Gromacs是否可以做cpptraj内类似的组合聚类分析
cpptraj可以将多个轨迹合并做组合聚类分析（Combined Clustering Analysis），请问现在Gromacs能否直接进行这样的分析，还是需要先转换成amber格式再用cpptraj分析

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-8 21:46
如果只是把多个轨迹合并起来做簇分析，gromacs里用trjcat合并后再用gmx cluster即可

作者
Author: MMMine 时间: 2023-8-11 13:34
那请问如果是类似下图，WT和两个点突变蛋白的三个轨迹可以合并用gmx cluster来达到相同的结果吗？

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)